Восемь лет прошло с той ночи, когда Бэтмен исчез, став изгоем. Он добровольно взял на себя вину за гибель Харви Дента, чтобы сохранить веру горожан в правосудие. Вместе с Гордоном они решили, что только ложь о "белом рыцаре" Денте может уберечь Готэм от хаоса. Брюс Уэйн, сломленный и отрекшийся от мира, заперся в особняке, а его тело и дух медленно угасают.
Тем временем в городе зреет новая угроза. Появляется загадочная воровка Селина Кайл, которая крадет личные вещи Уэйна, а вместе с ней приходит и террорист Бейн — человек с чудовищной силой и железной маской, который задумал уничтожить Готэм окончательно. Бейн захватывает фондовую биржу, устраивает побег из тюрьмы и заманивает Бэтмена в ловушку, где жестоко ломает ему позвоночник.
Брюс оказывается в глубокой яме-тюрьме, где, по легенде, только один узник смог выбраться без веревки. Пока он восстанавливается, Бейн берет Готэм под контроль, угрожая взорвать ядерную бомбу, если город попытается сопротивляться. Он изгоняет полицию в подземелья, а жителей заставляет жить в страхе и нищете, раскрывая правду о Денте, что рушит последние иллюзии.
Но Уэйн находит в себе силы подняться. Он выбирается из ямы, возвращается в разрушенный Готэм и собирает остатки союзников: Гордона, верного дворецкого Альфреда, который все это время поддерживал его, и Селину, которая, несмотря на свой цинизм, решает помочь. В финальной битве на улицах города Бэтмен сталкивается с Бейном, но понимает, что главная угроза — это бомба-детонатор. Он уносит устройство на своем летательном аппарате за пределы города, жертвуя собой, чтобы спасти всех.
Готэм празднует освобождение. Брюс Уэйн считается погибшим, но Альфред видит его в кафе вместе с Селиной — намек на то, что герой выжил и наконец обрел покой. Робин, молодой полицейский Джон Блейк, получает доступ в пещеру Бэтмена, готовый продолжить наследие. Город, очищенный от лжи, начинает новую жизнь, а легенда о Темном рыцаре остается в памяти как символ надежды.
